Neo o Thomas Anderson (Keanu Reeves)

Neo es el elegido, aunque como suele suceder en estos casos, él no lo sabe. Neo es un experto en ordenadores, y Morpheus se encarga de localizarlo para explicarle que en realidad no vive en 1999, sino dos milenios en el futuro, y que las máquinas son las responsables de que los humanos vivan en un engaño, ya que estas han tomado el control, y usan a los humanos para obtener la energía que necesitan, y que él, es según la profecía, el único humano que puede liderar una revolución contra las máquinas.

Trinity (Carrie-Anne Moss)

Trinity es la mano derecha de Morpheus, y este le ha enviado al mundo virtual conocido como Matrix para encontrar al elegido, pero al contrario que Morpheus, no cree que Neo sea la persona que están buscando, aunque a pesar de esta desconfianza inicial, acabará enamorándose de él. Curiosamente a ella ya le habían predicho que se enamoraría de el elegido. Su puesta en escena en la película no puede ser más impresionante. Trinity es descubierta por la policía, y en su huida se queda suspendida en el aire desafiando las leyes de la gravedad, en ese momento la cámara le "rodea", creando un efecto visual impactante.

Morfeo (Laurence Fishburne)

Morpheus es el líder de los rebeldes, y ha dedicado su vida a buscar a aquel que, según la profecía, vendrá para liberar a la humanidad del control de las máquinas, para después unirse a el en la gran lucha que tiene que llegar. Cuando encuentran a Neo, Morpheus es el único que está realmente convencido de que este es el elegido, tras rescatarlo de las entrañas de Matrix, Morpheus se encarga de entrenarlo en las diferentes técnicas de combate, lo que nos lleva a algunas de las secuencias más impresionantes de la película. El rescate final de Morpheus a cargo de Neo y Trinity es la parte más brutal del film.

El agente Smith (Hugo Weaving)

El agente Smith es una creación de las máquinas, como los demás agentes puede tomar cualquier forma al instante dentro del mundo de MATRIX, su misión es localizar y exterminar a los rebeldes. Ningún humano ha sobrevivido a un enfrentamiento directo con un agente, y este es el mejor, por eso los rebeldes intentan evitarlos a toda costa. Claro que esto cambiará con la aparición de Neo.

Cifra ó Sr. Reagan (Joe Pantoliano)

Cypher, el traidor, aparentemente  es fiel a la causa de los rebeldes, pero cypher prefiere la comodidad que le daría una vida enchufado al mundo de MATRIX, antes que la cruel y dura realidad que esta viviendo, por ello hace un pacto con los agentes, él les da la localización de la base rebelde y ellos a cambio le conectan al MATRIX haciéndole olvidar su pasado y dándole todas las comodidades. Naturalmente cuando sus compañeros se enteren de su traición, lo pagará caro.

Tanque (Marcus Chong),

Apoc (Julian Arabanga),

Interruptor (Belinda McClory),

Dozer (Anthony Ray Parker),

Ratón (Matt Doran) y

Oráculo (Gloria Foster).

Son miembros de las fuerzas rebeldes que se resisten a caer en el poder de las máquinas.